W przyjętym przez Sejm 12 grudnia 2012 budżecie państwa na 2013 rok znalazły się poprawki dotyczące sfery nauki.
I tak, przyjęta poprawka PO zmniejsza wydatki na działalność dydaktyczną w szkolnictwie wyższym o 498 tys. zł, a pieniądze te przeznacza na nową rezerwę "Finansowanie Chrześcijańskiej Akademii Teologicznej w Warszawie".
Pod koniec listopada, podczas prac nad projektem budżetu komisja finansów publicznych zgłosiła 18 poprawek, które wprowadzono do projektu. Wśród nich znalazły się m. in. wnioski przesuwające 300 tys. zł na Muzeum Pamięci Sybiru (z wydatków na kulturę) czy 500 tys. zł na Żydowski Instytut Historyczny w Warszawie (z budżetu Kancelarii Prezydenta RP na rewaloryzację zabytków Krakowa).
Uznanie komisji uzyskał też wniosek, by przeznaczyć dodatkowe 7 mln zł na dotacje dla uczelni kształcących personel lotniczy (obcinając wydatki na Instytut Pamięci Narodowej, Generalnego Inspektora Ochrony Danych Osobowych i Sąd Najwyższy). Zdecydowano także, by kosztem budżetów IPN i GIODO przekazać dodatkowe 5 mln zł na wynagrodzenia w Regionalnych Izbach Obrachunkowych.
Ponadto, w 2013 r. utrzymano zamrożenie funduszu wynagrodzeń we wszystkich jednostkach państwowej sfery budżetowej.
Teraz ustawa zostaje skierowana do Senatu, który ma na zgłoszenie swoich poprawek 20 dni od dnia przekazania ustawy przez Sejm.